ภาพยนตร์ซูเปอร์ฮีโร่สุดยิ่งใหญ่จากจักรวาล X-Men เล่าเรื่องราวของ อะพอคคาลิปส์ (Apocalypse) หรือ เอ็น ซาบาห์ นูร์ (En Sabah Nur) ซึ่งเป็น มนุษย์กลายพันธุ์คนแรก และ ทรงพลังที่สุด ในประวัติศาสตร์ของโลก

นับตั้งแต่รุ่งอรุณแห่งอารยธรรม เขาได้รับการ บูชาราวกับเทพเจ้า อะพอคคาลิปส์ได้รวบรวมพลังจากมนุษย์กลายพันธุ์คนอื่น ๆ มาอย่างยาวนานจนกลายเป็น อมตะและไร้เทียมทาน เมื่อเขา ตื่นขึ้นมาหลังจากเวลาผ่านไปหลายพันปี ในปี 1983 เขาก็รู้สึก ผิดหวังกับโลกที่พบเจอ ที่มีแต่ความวุ่นวายและความอ่อนแอของมนุษย์

ด้วยความปรารถนาที่จะ ชำระล้างมนุษยชาติ และสร้างระเบียบโลกใหม่ขึ้นมา โดยมีเขาเป็นผู้ปกครอง อะพอคคาลิปส์ได้รวบรวมทีมที่เรียกว่า สี่อัศวิน (Four Horsemen) ซึ่งเป็นมนุษย์กลายพันธุ์ผู้ทรงพลัง โดยหนึ่งในนั้นคือ แม็กนีโต (Magneto / Erik Lehnsherr) ผู้สิ้นหวังและเจ็บปวดจากการสูญเสียครอบครัว

ในขณะที่ ชะตากรรมของโลกกำลังตกอยู่ในห้วงแห่งความไม่แน่นอน เรเวน/มิสทีค (Raven/Mystique) ต้องร่วมมือกับ ศาสตราจารย์เอ็กซ์ (Professor X / Charles Xavier) เพื่อ นำทีมเอ็กซ์-เม็นรุ่นเยาว์ ทั้งจีน เกรย์, ไซคลอปส์, ไนท์ครอว์เลอร์, และบีสต์ เพื่อหยุดยั้งศัตรูตัวฉกาจ ที่ไม่มีใครเคยเผชิญหน้ามาก่อน และ ปกป้องมนุษยชาติจากการทำลายล้างอย่างย่อยยับ